В соответствии со статьёй 8 закона Алтайского края от 10 октября 2011 года № 123-ЗС «О Счётной палате Алтайского края» Счётная палата осуществляет следующие полномочия:
1) контроль за исполнением краевого бюджета и бюджета территориального государственного внебюджетного фонда;
2) экспертиза проектов законов Алтайского края о краевом бюджете и проектов законов Алтайского края о бюджете территориального государственного внебюджетного фонда;
3) внешняя проверка годового отчёта об исполнении краевого бюджета, годового отчёта об исполнении бюджета территориального государственного внебюджетного фонда;
4) организация и осуществление контроля за законностью, результативностью (эффективностью и экономностью) использования средств краевого бюджета, средств бюджетов территориальных государственных внебюджетных фондов и иных источников, предусмотренных законодательством Российской Федерации;
5) контроль за соблюдением установленного порядка управления и распоряжения имуществом, находящимся в государственной собственности Алтайского края, в том числе охраняемыми результатами интеллектуальной деятельности и средствами индивидуализации, принадлежащими Алтайскому краю;
6) оценка эффективности предоставления налоговых и иных льгот и преимуществ, бюджетных кредитов за счет средств краевого бюджета, а также оценка законности предоставления государственных гарантий и поручительств или обеспечения исполнения обязательств другими способами по сделкам, совершаемым юридическими лицами и индивидуальными предпринимателями за счёт средств краевого бюджета и имущества, находящегося в государственной собственности Алтайского края;
7) финансово-экономическая экспертиза проектов законов Алтайского края и нормативных правовых актов органов государственной власти Алтайского края (включая обоснованность финансово-экономических обоснований) в части, касающейся расходных обязательств Алтайского края, а также государственных программ Алтайского края;
8) анализ бюджетного процесса в Алтайском крае и подготовка предложений, направленных на его совершенствование;
9) контроль за законностью, результативностью (эффективностью и экономностью) использования органами местного самоуправления межбюджетных трансфертов, выделенных местным бюджетам из краевого бюджета, в том числе использования средств для реализации переданных государственных полномочий; проверка местных бюджетов - получателей межбюджетных трансфертов из краевого бюджета, в случаях, установленных Бюджетным кодексом Российской Федерации;
10) подготовка информации о ходе исполнения краевого бюджета, бюджета территориального государственного внебюджетного фонда, о результатах проведенных контрольных и экспертно-аналитических мероприятий и представление такой информации в Алтайское краевое Законодательное Собрание и Губернатору Алтайского края;
11) контроль за ходом и итогами реализации программ и планов развития Алтайского края;
12) мониторинг исполнения краевого бюджета и бюджета территориального государственного внебюджетного фонда;
13) участие в пределах полномочий в мероприятиях, направленных на противодействие коррупции;
14) иные полномочия в сфере внешнего государственного финансового контроля, установленные федеральными законами и законами Алтайского края.